homogentisate 1,2-dioxygenase (HGD) - 4617 nt intron 13 reference sequence

(intronic numbering for coding DNA Reference Sequence)


         .         .         .         .         .         .  g.49469
gtaagtatgttaactgccacattccagcggcctctgaactccccacccttactgagaggg  c.1188+60

         .         .         .         .         .         .  g.49529
gtggccgtttttcatttctccaaagtcacagaggaagagtcaaaagagggagagttaatg  c.1188+120

         .         .         .         .         .         .  g.49589
actgcataagtatgtttacatgtatatatactcacatccttgtgtatatactagacttct  c.1188+180

         .         .         .         .         .         .  g.49649
gttgtggtggtgtagaaagatcgttggacttggagtcagacctgggttctgagtttaagt  c.1188+240

         .         .         .         .         .         .  g.49709
cccatctcttagttcctacaggatcttgaacaactcacttagcttctctgtgcttcattt  c.1188+300

         .         .         .         .         .         .  g.49769
tccccatctataaaatgggtatagtatccaacccagcagatggctatgagttaacctaac  c.1188+360

         .         .         .         .         .         .  g.49829
agactgtccaacactattcaaatgtaagggaacattattaatactatgtgaagcctcttc  c.1188+420

         .         .         .         .         .         .  g.49889
ctgtatccttatgcagccctgggcatatgctatgtctcagagtcttctgcgttttgaagt  c.1188+480

         .         .         .         .         .         .  g.49949
aatcctccagggccacagtagtagcggaggcaggatctcaccttcagcacgtgtttcaag  c.1188+540

         .         .         .         .         .         .  g.50009
ccaaggagggtcaaaaagcccttgcctcactatagtcagggcttgtgagaagcaattctc  c.1188+600

         .         .         .         .         .         .  g.50069
agctgttttttgcattttcctttgctctgctttggcatggatgcaactgatgggatttaa  c.1188+660

         .         .         .         .         .         .  g.50129
aacctgttttgtattcttcctgtgtcaggctgtaaacattgaggctgaacacaattgcag  c.1188+720

         .         .         .         .         .         .  g.50189
ctggctgcggtgcttgattttattttatttttgcattcttcgaggtagagtttatggtcc  c.1188+780

         .         .         .         .         .         .  g.50249
acagggagtaattttatgctaaatcacatgcaaatttgctttacttttgaaaataaatgc  c.1188+840

         .         .         .         .         .         .  g.50309
cttcaatgctacctggtttaaaatctatagcagagacctgcctgcttcatgcttgcaaac  c.1188+900

         .         .         .         .         .         .  g.50369
tacctaaacagtgagcattatctgtccgtctgtccactgcagtttgctttcagtcccaac  c.1188+960

         .         .         .         .         .         .  g.50429
cctggagccagagttggtggagctcctttgcaaaaggagggtgttcagagtcccatttgc  c.1188+1020

         .         .         .         .         .         .  g.50489
ttgctttggctctatttcccctttcaagggcctctatggagtttctgtagaacccctaca  c.1188+1080

         .         .         .         .         .         .  g.50549
tctcaaagagatgcagtctggcagtctcagttaagctattacctctgaagtctcctggag  c.1188+1140

         .         .         .         .         .         .  g.50609
gtgcagtcctggaggctattctagagttgccactcaataacctttggtcccccaatttgg  c.1188+1200

         .         .         .         .         .         .  g.50669
ctttgggtagtcaatgttatgagggagctgtgttttacaacagtgaggcgtaggacaggg  c.1188+1260

         .         .         .         .         .         .  g.50729
ctgtttctatgaggagcaatactttgaattactagtgagaaagagctctcctattaggat  c.1188+1320

         .         .         .         .         .         .  g.50789
gggagaccctgggtatcaaggagccagaatacctgatggcggagggtccaacatcttacc  c.1188+1380

         .         .         .         .         .         .  g.50849
tagacctaactttcagtcgtcctcaccatttcccattatataattcagacccaggtctat  c.1188+1440

         .         .         .         .         .         .  g.50909
ctacatgccttatccttattcttgtttggagtgattaacttggtacaatagcatcttcaa  c.1188+1500

         .         .         .         .         .         .  g.50969
agtcagctgggatggggcttttgttaatccagccaaatggagaggcttttaagaagcagt  c.1188+1560

         .         .         .         .         .         .  g.51029
cagcaaagagacaatagcaatggccataatgatccttgtatgtgaatagtgctttttaaa  c.1188+1620

         .         .         .         .         .         .  g.51089
aatctttattacttattatttattatttttatggatacataataagtatgtatatttatg  c.1188+1680

         .         .         .         .         .         .  g.51149
gggtacatgagatatgatgatacaggcatatgatacgtaataatcacatcaagataaatg  c.1188+1740

         .         .         .         .         .         .  g.51209
gggtatccattacctcaagcatttatcctttgtgttacaaacaatccaattatattcttt  c.1188+1800

         .         .         .         .         .         .  g.51269
cagttattttaaaatgtgcaattaaatttttattgactatggtcaccctgttatgctatc  c.1188+1860

         .         .         .         .         .         .  g.51329
aaatgctaggtcttattcattttttttcttttatttctttatttatttttaacttttatt  c.1188+1920

         .         .         .         .         .         .  g.51389
tgaggttcaggggtacatgtgaagatttgttatataggtaaactgatgtcacaggggttt  c.1188+1980

         .         .         .         .         .         .  g.51449
attgtacagattatttcatcactcgggtactaaacagtacccaatagttattttttctga  c.1188+2040

         .         .         .         .         .         .  g.51509
ttctctccctcctcccaccctctattctcaagtaggcatcagtgtctgttgctcccctct  c.1188+2100

         .         .         .         .         .         .  g.51569
ttgtgtccacaagttctcatcatttagctcccatttagaagtgagaacatacaatatttg  c.1188+2160

         .         .         .         .         .         .  g.51629
gttttctgttcctcttagtttgccaaggataatggcctccagctccgtcgtgttcctgag  c.1188+2220

         .         .         .         .         .         .  g.51689
aaacacatgatcttgttcttttttatggctgcatagtattccattatctgtgtgtgtgtg  c.1188+2280

         .         .           g.51718
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgt  c.1188+2309

--------------------- middle of intron ---------------------
                   g.51719              .         .           g.51746
                   c.1189-2308  gtgtgtatgtgtatatatatatatatat  c.1189-2281

.         .         .         .         .         .           g.51806
atatatatataaagctcttaagtttaattagatccatttgtcaatttttcttttgttgcc  c.1189-2221

.         .         .         .         .         .           g.51866
aattgcttttgatgtttttgtcatgaaatctttgcccatgctgatgtcctgaatggtatt  c.1189-2161

.         .         .         .         .         .           g.51926
gcctaggtcatcttccagagtttttatagttttgggcttaacatttaagtccttaatcca  c.1189-2101

.         .         .         .         .         .           g.51986
tcatgagttggtttttctatatggtgtatggaagcggtccagtttaaatcttctgcttat  c.1189-2041

.         .         .         .         .         .           g.52046
gactagccagttgtcccagcatgatttattgaatagatagtcctttccccattgcttgtt  c.1189-1981

.         .         .         .         .         .           g.52106
tttgtcagcttcattgaaaatcggatggttataggtgtgcggccttgtttctgggctctc  c.1189-1921

.         .         .         .         .         .           g.52166
tattctgttccattggtctatgtgcctgtttctgtatcattaccacactgttttggttac  c.1189-1861

.         .         .         .         .         .           g.52226
tgtagccttgtagtatactttgaagttgggtagcatgatgcctcctgctttgttcttttt  c.1189-1801

.         .         .         .         .         .           g.52286
gcttaggatagccttgggtatttgggctcttttttggttccatatgaattttaaaatagt  c.1189-1741

.         .         .         .         .         .           g.52346
ctttcctagttctgtgaagaatgtcgttggtattttgatatgaacagcgttgaatcttta  c.1189-1681

.         .         .         .         .         .           g.52406
cattgctttggatagtatcgtcatcttaatgatgttgattcttcctacccatgagcatgg  c.1189-1621

.         .         .         .         .         .           g.52466
aaagtttttccatttgtttgtgtcttctctgatttctttgagcagtgttttgtaattctc  c.1189-1561

.         .         .         .         .         .           g.52526
attatagagacctttcacctctctggttaggggtattcctaggtattttattctttttgt  c.1189-1501

.         .         .         .         .         .           g.52586
ggcagttgtgaatgggattgcattcctgatttggctttcagcttgactgttgttggtgta  c.1189-1441

.         .         .         .         .         .           g.52646
taggaatgctagtgatttttgtacattgattttgtatcatgaactttgctgaaagttgtt  c.1189-1381

.         .         .         .         .         .           g.52706
tattggttgaaggagcttttgggctgagactatggtgttttctagatatagaatcaggtc  c.1189-1321

.         .         .         .         .         .           g.52766
atctgcaaacagggataggttgacttcttctcttctggatgcactttatttctttctatt  c.1189-1261

.         .         .         .         .         .           g.52826
gcctgattactctttgccacgacttctaagactatgttgaataggagtggtgagagagag  c.1189-1201

.         .         .         .         .         .           g.52886
catccttgtcttatgctggttttcaaagggaatgcttccagcttttccccattcagtatg  c.1189-1141

.         .         .         .         .         .           g.52946
atgttggctgtgggtttgtcataggtggctcttattattctgtgatgtgttccttcaatg  c.1189-1081

.         .         .         .         .         .           g.53006
cctagtttattgagagtttttaacttgaagatatactgaattttattgaaagccttttct  c.1189-1021

.         .         .         .         .         .           g.53066
gcatcttgaatagcactgtataacttgcatagcacttccatatgatctcatccagtcttc  c.1189-961

.         .         .         .         .         .           g.53126
ccatcaagcctgtcacaggaaatcaggcagcgatactcatatccattgttttagacaaaa  c.1189-901

.         .         .         .         .         .           g.53186
ataatttaatgtatattagagcccaaacattaatgtgggtgctttgggttgtagcacaag  c.1189-841

.         .         .         .         .         .           g.53246
ataattctattattttccttttgcctgtctgtattatacaaatttccaaatgtgagcata  c.1189-781

.         .         .         .         .         .           g.53306
taagaattgtagggtttggtttttgggttttgttttgtttttaaagccacagtggataag  c.1189-721

.         .         .         .         .         .           g.53366
aaaagtcagcaattgatgaagctgtaatgtctaagatgcacagagtatttacatattctt  c.1189-661

.         .         .         .         .         .           g.53426
tctgttgtggacaaaaacctcctgacagtgcaacatccaccattcagacacttctgagat  c.1189-601

.         .         .         .         .         .           g.53486
atgacttttaaaagtgctacagccattcctgccatttccttcacctccctctcctcccca  c.1189-541

.         .         .         .         .         .           g.53546
ctccctttttcccttttcccagcccatctcttggtcagagtcctgaaaagacaggctcaa  c.1189-481

.         .         .         .         .         .           g.53606
atcccagttctgcgatgacttgtcgccttaagcaagtcgtttcccagctctcagccttaa  c.1189-421

.         .         .         .         .         .           g.53666
ttcctcctctgcaaaatgggaagtatgactttcctcacaaggacatagccacagtaagtg  c.1189-361

.         .         .         .         .         .           g.53726
aaggccctcagaagatggatattcccaggattctcccatgtctgcccttggatctagcag  c.1189-301

.         .         .         .         .         .           g.53786
acttagttccgtaataccatgaagataatttgaagcttaagggctgaattttattttaca  c.1189-241

.         .         .         .         .         .           g.53846
gaatgaaacttgaggccctgagaagttaagggtcttgtaccaggtctcaccagcttacaa  c.1189-181

.         .         .         .         .         .           g.53906
atggtaggaccagagccacaactcagggcttgagcctgctctcctcaccactctagcaca  c.1189-121

.         .         .         .         .         .           g.53966
caaatctttgatttgttattggaagatttcacctacccataccttctgttgacatctaat  c.1189-61

.         .         .         .         .         .           g.54026
caaatgtgtttattatctatctcacctcttttttctcatccccatcgtcacttcctccag  c.1189-1


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